Южно-Уральский государственный аграрный университет успешно прошел аккредитационную экспертизу. Согласно приказу №1254 от 21.07.2017 года ЮУрГАУ в очередной раз подтвердил право на подготовку кадров высшей квалификации по следующим программам обучения в аспирантуре: 05.00.00 – Науки о Земле, 06.00.00 – Биологические науки, 19.00.00 – Промышленная экология и биотехнологии, 36.00.00 – Ветеринария и зоотехния.
В университете работают два диссертационных совета. Ежегодно в ЮУрГАУ проходят защиты диссертаций на соискание ученой степени кандидата и/или доктора наук. Результаты научных исследований широко представлены в журнале университета «АПК России».